- On the three distance theorem, The Mathematical Intelligencer 2024 (avec Valérie Berthé)
- Quivers of stylic algebras, Algebraic Combinatorics 2023 (avec Antoine Abram et Franco Saliola)
- The palindromization map, Discrete Applied Mathematics 2023 (avec Dominique Perrin)
- The stylic monoid, Semigroup Forum 2022 (avec Antoine Abram)
- A noncommutative extension of Mahler’s interpolation theorem, Journal of Noncommutative Theory 2022 (avec Jean-Eric Pin)
- Christoffel words and weak Markoff theory, Advances in Applied Mathematics 2021
- Primitive elements of the Hopf algebras of tableaux, European Journal of Combinatorics 2021 (avec Claudia Malvenuto)
- On the Frobenius conjecture, Integers 2021 (avec Mélodie Lapointe)
- On quadratic numbers and forms, and Markoff theory, Journal of Number Theory 2021
- Graded alphabets, circular codes, free Lie algebras and comma-free codes, Discrete Mathematics 2021 (avec Dominique Perrin)
- Palindromization and construction of Markoff triples, Theoretical Computer Science 2020 (avec Antoine Abram et Mélodie Lapointe)
- An order on circular permutations, The Electronical Journal of Combinatorics 2020 (avec Antoine Abram et Nathan Chapelier)
- Combinatorics on Words and the Theory of Markoff, in: Computation and Combinatorics in Dynamics, Stochastics and Control, Abel Symposia 2019
- Quasi-automatic semigroups, Theoretical Computer Science 2019 (avec Bernard Blanchette et Christian Choffrut)
- On the Stern-Brocot expansion of real numbers, Journal de Théorie des Nombres de Bordeaux 2019
- On generalized Lyndon words, Theoretical Computer Science 2019 (avec Francesco Dolce et Antonio Restivo)
- Complete determination of the zeta function of the Hilbert scheme of n points on a two-dimensional torus, Ramanujan Journal 2018 (avec Christian Kassel)
- Counting the ideals of given codimension of the algebra of Laurent polynomials in two variables, Michigan Mathematical Journal 2018 (avec Christian Kassel)
- Golden ratio and phyllotaxis, a clear mathematical link, Journal of Mathematical Biology 2018 (avec François Bergeron)
- Birecurrent sets, International Journal of Algebra and Computation 2018 (avec Francesco Dolce, Dominique Perrin, Antonio Restivo et Giuseppina Rindone)
- Hall sets, Lazard sets and comma-free codes, Discrete Mathematics 2018 (avec Dominique Perrin)
- The Fourier expansion of η(z)η(2z)η(3z)/η(6z), Archiv der Mathematik 2017 (avec Christian Kassel)
- Palindromic closures and Thue-Morse substitution for Markoff numbers, Uniform Distribution Theory 2017 (avec Laurent Vuillon)
- Number of right ideals and a q-analogue of indecomposable permutations, Canadian Journal of Mathematics 2016 (avec Roland Bacher)
- Studies on finite Sturmian words, Theoretical Computer Science 2015
- Return words of linear involutions and fundamental groups, Ergodic Theory & Dynamical Systems 2015 (avec Valérie Berthé,Vincent Delecroix, Francesco Dolce, Dominique Perrin, et Giuseppina Rindone)
- A d-dimensional extension of Christoffel words, Discrete Computational Geometry 2015 (avec Sébastien Labbé)
- Algebraicity of the zeta function associated to a matrix over a free group algebra, Algebra and Number Theory 2014 (avec Christian Kassel)
- The reciprocal of \sum a^nb^n for non-commuting a and b, Catalan numbers and non-commutative quadratic equations, Contemporary Mathematics 2013 (avec Arkady Berenstein, Vladimir Retakh, et Doron Zeilberger)
- The number of right ideals of given codimension over a finite field, Contemporary Mathematics 2013 (avec Roland Bacher)
- On a Class of Lyndon Words Extending Christoffel Words and Related to a Multidimensional Continued Fraction Algorithm, Journal of Integer Sequences 2013 (avec Guy Melançon)
- Rational series in the free group and the Connes operator, Contemporary Mathematics 2013 (avec Aaron Lauve)
- Recent results on syntactic groups of prefix codes, European Journal of Combinatorics 2012 (avec Jean Berstel, Clelia De Felice, Dominique Perrin et Giuseppina Rindone)
- On a matrix representation for polynomially recursive sequences, The Electronic Journal of Combinatorics 2012
- Mutating seeds: type A and \tilde A, Annales Mathématiques Blaise Pascal 2012 (avec Ibrahim Assem)
- On an algebraicity theorem of Kontsevich, Discrete Mathematics & Theoretical Computer Science Proceedings 2012 (avec Marco Robado)
- Bifix codes and Sturmian words, Journal of Algebra 2012 (avec Jean Berstel, Clelia De Felice, Dominique Perrin et Giuseppina Rindone)
- A bijection between words and multisets of necklaces, European Journal of Combinatorics 2012 (avec Ira Gessel et Antonio Restivo)
- Christoffel words and the Calkin-Wilf tree, The Electronic Journal of Combinatorics 2011 (avec Alessandro De Luca)
- Complexity and palindromic defect of infinite words, Theoretical Computer Science 2011 (avec Srecko Brlek)
- Generalized descent patterns in permutations and associated Hopf algebras, European Journal of Combinatorics 2011 (avec Jean-Christophe Novelli et Jean-Yves Thibon)
- On the superimposition of Christoffel words, Theoretical Computer Science 2011 (avec Geneviève Paquin)
- Codes and noncommutative stochastic matrices, Journal of Noncommutative Geometry 2010 (avec Sylvain Lavallée, Dominique Perrin et Vladimir Retakh)
- SL_k-tilings of the plane, Illinois Journal of Mathematics 2010 (avec François Bergeron)
- Friezes, Advances in Mathematics 2010 (avec Ibrahim Assem et David Smith)
- Christoffel Words and Markoff Triples, Integers 2009
- Characteristic polynomials of nonnnegative integral square matrices and clique polynomials, Séminaire Lotharingien de Combinatoire 2009 (avec Sylvain Lavallée)
- Lyndon + Christoffel = digitally convex, Pattern recognition 2009 (avec Srecko Brlek, Jacques-Olivier Lachaud, et Xavier Provençal)
- A Sturmian sequence related to the uniqueness conjecture for Markoff numbers, Theoretical Computer Science 2009 (avec Yann Bugeaud et Samir Siksek)
- Another proof of Soittola’s theorem, Theoretical Computer Science 2008 (avec Jean Berstel)
- A palindromization map for the free group, Theoretical Computer Science 2008 (avec Christian Kassel)
- Le jeu de taquin de Schützenberger, Gazette de mathématiciens 2008
- On an involution of Christoffel words and Sturmian morphisms, European Journal of Combinatorics 2008 (avec Vaérie Berthé et Aldo de Luca)
- Invariants and Coinvariants of the Symmetric Group in Noncommuting Variables, Canadian Journal of Mathematics 2008 (avec Nantel Bergeron, Mercedes Rosas, Mike Zabrocki)
- Michel Fliess and non-commutative formal power series, International Journal of Control 2008
- Extension of Brzozowski’s derivation calculus of rational expressions to series over the free partially commutative monoids, Theoretical Computer Science 2008 (avec Jean Berstel)
- Sturmian morphisms, the braid group B_4, Christoffel words and bases of F_2, Annali di Matematica 2007 (avec Christian Kassel)
- On a zeta function associated with automata and codes, Theoretical Computer Science 2007 (avec Sylvain Lavallée)
- On Christoffel classes, RAIRO Informatique théorique 2006 (avec Jean-Pierre Borel)
- Mots de Lyndon généralisés, Séminaire lotharingien de Combinatoire 2006
- On Markoff’s property and Sturmians words, Mathematische Annalen 2006
- P-partitions and a multi-parameter Klyachko idempotent, The Electronic Journal of Combinatorics 2005 (avec Peter McNamara)
- On the Garsia Lie Idempotent, Canadian Mathematical Bulletin 2005 (avec Frédéric Patras et Manfred Schocker)
- Palindromic factors of billiard words, Theoretical Computer Science 2005 (avec Jean-Pierre Borel)
- Some new results on palindromic factors of billiard words, Lecture Notes in Computer Science 2005 (avec Jean-Pierre Borel)
- On descent algebras and twisted bialgebras, Moscow Mathematical Journal 2004 (avec Frédéric Patras)
- Commutative/noncommutative rank of linear matrices and subspaces of matrices of low rank, Séminaire Lotharingien de Combinatoire 2004 (avec Marc Fortin)
- On the palindromic complexity of infinite words, International Journal of Foundations of Computer Science 2004 (avec Srecko Brlek, Sylvie Hamel et Maurice Nivat)
- The singular locus of a Schubert variety, Journal of Algebra 2003 (avec Alain Lascoux et Christian Kassel)
- Lyndon words, permutations and trees, Theoretical Computer Science 2003 (avec Christophe Hohlweg)
- Free Lie Algebras, Handbook of Algebra 2003
- On a valuation of rational subsets of Z^k, Theoretical Computer Science 2003 (avec Srecko Brlek)
- Lie representations and an algebra containing Solomon’s, Journal of Algebraic Combinatorics 2002 (avec Frédéric Patras)
- On Dynkin and Klyachko Idempotents in Graded Bialgebras, Advances in Applied Mathematics 2002 (avec Frédéric Patras)
- Eine Symmetrieeigenschaft von Solomons Algebra und der höheren Lie-Charaktere, Abhandlungen des Seminars der Universität Hamburg 2001 (avec Armin Jöllenbeck)
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- Factorizations in Schubert cells, 2000 (avec Alain Lascoux et Christian Kassel)
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- Noncommutative Rational Functions and Farber’s invariants of boundary links, 1999 (avec Vladimir Retakh et Arkady Vaintrob)
- Higher Lie idempotents, 1999 (avec Frédéric Patras)
- A proof of Choffrut’s theorem on subsequential functions, Theoretical Computer Science 1999 (avec Véronique Bruyère)
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- Plethysm and conjugation of quasi-symmetric functions, Discrete Mathematics 1998 (avec Claudia Malvenuto)
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- A Survey of Noncommutative Rational Series, DIMACS Series in Discrete Mathematics and Theoretical cal Computer Science 1996
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- Algèbre de Hopf de tableaux, Annales des Sciences mathématiques du Québec 1995 (avec Stéphane Poirier)
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- Subsequential functions: characterizations, minimization, examples, Lecture Notes in Computer Science 1990
- Combinatorial resolution of systems of differential equations III: a special class of differentially algebraic series, European Journal of Combinatorics 1990 (avec François Bergeron)
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- A formula for the determinant of a sum of matrices, Letters in mathematical physics 1987 (avec Marcel-Paul Schützenberger)
- Theorem of Poincaré-Birkhoff-Witt, logarithm and symmetric group representations of degree equal to Stirling numbers, Lecture Notes in Mathematics 1986
- The local realization of generating series of finite Lie rank, 1986
- Mots de Lyndon et un théorème de Shirshov, Annales des Sciences mathématiques du Québec 1986
- Ensembles libres de chemins dans un graphe, Bulletin de la Société mathématique de France 1986
- Noncommutative factorization of variable-length codes, Journal of Pure and Applied Algebra 1985
- The shuffle algebra on the factors of a word is free, Journal of Combinatorial Theory 1985
- Rational languages and the Burnside problem, Theoretical Computer Science 1985 (avec Antonio Restivo)
- Sur les semi-groupes vérifiant le théorème de Kleene, RAIRO Informatique théorique 1985
- Inversion of matrices over a commutative semiring, Journal of Algebra 1984 (avec Howard Straubing)
- On formal power series defined by infinite linear systems, Theoretical Computer Science 1984 (avec Gérard Jacob)
- Factorizing the polynomial of a code, Transactions of the American mathematical society, 1984 (avec George Hansel et Dominique Perrin)
- On the Burnside problem for semigroups, Journal of Algebra 1984 (avec Antonio Restivo)
- On cancellation properties of languages which are support of rational power series, Journal of Computer and System Sciences 1984 (avec Antonio Restivo)
- Cyclic derivations of noncommutative algebraic power series, Journal of Algebra 1983
- Sulla fattorizzazione dei codici, Ricerche di Matematica 1983
- Théorie de Picard-Vessiot des systèmes réguliers (ou bilinéaires), 1983 (avec Michel Fliess)
- Some applications of a theorem of Shirshov to language theory, Information and Control 1983 (avec Antonio Restivo)
- Sur mon article « une topologie du monoïde libre », Semigroup Forum 1981.
- Une application de l’algèbre différentielle aux systèmes réguliers (ou bilinéaires), 1982
- Sur les éléments inversibles de l’algèbre de Hadamard des séries rationnelles, Bulletin de la Société mathématique de France 1982
- Recognizable formal power series on trees, Theoretical Computer Science 1982 (avec Jean Berstel)
- Sur l’algèbre associée à un code bipréfixe, Note aux Comptes Rendus de l’Académie des Sciences 1981
- Point générique du plus petit groupe algébrique dont l’algèbre de Lie contient plusieurs matrices données, Note aux Comptes Rendus de l’Académie des Sciences 1981.
- Propriétés arithmétiques de séries rationnelles et ensembles denses, Acta Arithmetica 1981
- Semisimplicity of the algebra associated to a biprefix code, Semigroup Forum 1981
- An Ogden-like iteration lemma for rational power series, Acta Informatica 1980
- Séries formelles et algèbres syntactiques, Journal of Algebra 1980
- On Polya series in noncommuting variables, Actes du Colloque Foundations in Computer Science 1979
- Sur les séries associées à certains systèmes de Lindenmayer, Theoretical Computer Science 1979
- Une topologie du monoïde libre, Semigroup Forum 1979
- Une caractérisation des anneaux de Fatou faibles, Note aux Comptes rendus de l’Académie des Sciences 1978
- Une caractérisation de la finitude de l’ensemble des coefficients d’une série rationnelle en plusieurs variables non commutatives, Note aux Comptes Rendus de l’Académie des Sciences 1977
- On a question of Eilenberg, Theoretical Computer Science 1977